Huisdieren
Habitatverlies en -fragmentatie: De primaire oorzaak van de afname van de zwartevoetfret was het verlies en de fragmentatie van zijn habitat. Deze fretten zijn afhankelijk van kolonieën van prairiehen voor schuilplaats, voedsel en voortplanting. De wijdverspreide uitholling van prairiehen door menselijke vervolging, ziekten en habitatconversie voor landbouw en verstedelijking resulteerde in het verlies van vitaal habitat voor zwartevoetfretten.
Ziekten: Een ander kritiek factor die bijdroeg aan de bedreiging van zwartevoetfretten was ziekteoverdracht van huisfretten en andere roofdieren. Hondesiekte, caniïne hepatitis en hondesiekte zijn onder de ziekten die dodelijk bleken voor zwartevoetfretten, wat hun al krimpende populaties verder verminderde.
Kleine Populatie en Genetische Diversiteit: Zwartevoetfretten hebben van nature kleine populaties, wat ze gevoeliger maakt voor de impact van habitatverlies en ziekten. Daarnaast verhoogde hun beperkte genetische diversiteit het risico op inteelt en verminderde de capaciteit van de soort om zich aan te passen aan veranderende omstandigheden.
Predatie: Met gereduceerd habitat en afnemende aantallen werden zwartevoetfretten kwetsbaarder voor predatie door grotere roofdieren zoals coyotes en dassen. Dit voegde zich bij de afname van hun populaties.
Door deze gecombineerde factoren daalde de populatie van de zwartevoetfret tot bijna uitsterven in de wilde natuur Mitte 20e eeuw. Behoudsinspanningen, waaronder opfokprogramma's en herintroducties, hebben geholpen de soort terug te brengen van de rand, maar ze blijven kritiek bedreigd en staan lopende uitdagingen voor hun overleving tegenover.