Keizerpinguïns lopen een significant risico op populatie-afname tegen het jaar 2100 door klimaatverandering. Studies met behulp van verschillende klimaatscenario's projecteren de volgende gevolgen:
- Verlies van zee-ijs: Keizerpinguïns zijn afhankelijk van stabiel zee-ijs voor broeden en het grootbrengen van kuikens. Afnemende omvang en duur van zee-ijs brengen kolonies in gevaar.
- Overstroming van kolonies en verlies van nesten: Smeltend ijs en stijgende zeespiegels kunnen nestplaatsen overstromen, eieren en kuikens vernietigen en leiden tot verlaten kolonies.
- Voedselbeschikbaarheid: Veranderingen in zee-ijsecosystemen beïnvloeden de distributie van vis, krill en andere prooien, waardoor de voedselvoorziening van de pinguïns afneemt.
- Overlevingskans van kuikens: Toegenomen stormen en harde wind die samenhangen met klimaatverandering kunnen de sterfte van kuikens verhogen.
- Verschuivingen van verspreidingsgebied: Naarmate zee-ijs afneemt, kunnen pinguïns gedwongen worden te verhuizen, wat hen in conflict brengt met andere soorten en nieuwe ecologische uitdagingen.
Projecties variëren sterk, met potentiële dalingen van 20–30% tot zo veel als 50–70%, afhankelijk van het tempo van klimaatverandering en het succes van natuurbeschermingsinspanningen.