Alligatorhabitats variëren per soort:
- Amerikaanse alligator: Zoetwater moerassen, rivieren, meren, moerassen in zuidoostelijke VS.
- Chinese alligator: Zoetwater habitats in oostelijk China, met name Yangtze-rivierbekken.
- Zwarte kaiman: Zoetwater moerassen, rivieren, meren in Zuid-Amerika.
- Amerikaanse krokodil: Kustmoerassen, rivieren, estuaria in Noord-, Midden-, Zuid-Amerika.
- Zee-krokodil: Kusthabitats, estuaria, mangroven, brakwater in Zuidoost-Azië en noordelijk Australië.
Alligatoren prefereren ondiep, begroeid water en bouwen nesten aan rivier- of meeroevers. Ze zijn half-waterbewonend en zonnen zich op land.
