Verschillende factoren kunnen de zichtbaarheid van celstructuren tijdens microscopie beperken:
- Beperkingen van de resolutie: Sommige structuren zijn te klein om te worden opgelost.
- Monstervorbereitung: Fixatie, kleuring en snijden kunnen artefacten introduceren of structuren veranderen.
- Kleuringstechnieken: Ongekleurde of zwak gekleurde componenten kunnen onzichtbaar zijn.
- Beperkingen van beeldvorming: Verlichting, contrast en scherpstelling beïnvloeden de beeldkwaliteit.
- Scenic diepte: Structuren buiten het focustvlak erscheinen wazig.
- Monsterdikte: Overliggende lagen kunnen diepere structuren verbergen.
- Membraanpermeabiliteit: Sommige compartimenten beperken de toegang van kleurstoffen.
- Cel dynamiek: Tijdelijke componenten zijn moeilijk op een specifiek moment vast te leggen.
Geavanceerde technieken zoals confocale, super-resolutie en elektronenmicroscopie hebben het vermogen om kleine celcomponenten te observeren verbeterd.