Huisdieren
Soorten definiëren op basis van kruiselings is moeilijk toe te passen op eencellige organismen om verschillende redenen.
Veel eencellige organismen planten alseksueel voort, wat nakomelingen genereert die genetisch identiek zijn aan de ouder. In deze gevallen zijn kruiselings en de uitwisseling van genetisch materiaal tussen individuen irrelevant.
Eencellige populaties wisselen vaak genetisch materiaal uit via mechanismen zoals conjugatie, transformatie of transductie. Deze processen kunnen plaatsvinden tussen genetisch diverse individuen, waardoor het moeilijk is om duidelijke soortgrenzen te trekken op basis van kruiselings alleen.
Horizontale genoverdracht is algemeen onder eencellige organismen, waardoor genen tussen verwante soorten kunnen verplaatsen. Dit kan nieuwe kenmerken en genetische diversiteit introduceren, wat soortdefinities die gebaseerd zijn op kruiselings verder bemoeilijkt.
Korte generatietijden en hoge mutatiesnelheden leiden tot snelle evolutie in veel eencellige populaties. In de loop van de tijd kunnen genetisch verre individuen onvermogend worden om te kruisen, wat soortlijnen nog verder vervaagt.
Omdat het concept van soort uiteindelijk een menselijke constructie is, vertrouwen onderzoekers die eencellig leven bestuderen doorgaans op een combinatie van genetische, fenotypische en ecologische gegevens in plaats van kruiselings alleen om soortgrenzen af te bakenen.