De Mojavewoestijn ondersteunt een divers planten- en dierenleven, maar veel soorten worden bedreigd met uitsterven door habitatverlies, klimaatverandering en andere druk. Enkele van de meest bedreigde soorten zijn onder andere:
- Woestijnschildpad: Bedreigd door habitatverlies, klimaatverandering en illegale verzameling.
- Mohave grondecureuil: Een klein knaagdier dat wordt bedreigd door habitatverlies, klimaatverandering en niet-inheemse roofdieren.
- Gila-monster: Een giftige hagedis die wordt bedreigd door habitatverlies, klimaatverandering en illegale verzameling.
- Gebandeerd Gila-monster: Staat voor vergelijkbare bedreigingen van habitatdegradatie en illegale handel.
- Platstaarthorengedektenis: Bedreigd door habitatverlies, klimaatverandering en predatie door niet-inheemse soorten.
- Mojave franjevingerhagedis: Een kleine hagedis die wordt bedreigd door habitatverlies, klimaatverandering en invasieve roofdieren.
- Panamint aligatorhagedis: Bedreigd door habitatverlies, klimaatverandering en niet-inheemse predatie.
- Westelijke holenuil: Bedreigd door habitatverlies, klimaatverandering en predatie door niet-inheemse soorten.
- Phainopepla: Een zangvogel die wordt bedreigd door habitatverlies, klimaatverandering en concurrentie met niet-inheemse soorten.
Er zijn natuurbeschermingsinspanningen gaande, maar er is extra actie nodig om ervoor te zorgen dat deze soorten overleven.