Wetenschappers gebruiken meerdere bewijslijnen om dieren-fylogenetische bomen te construeren:
- 1. Vergelijkende Morphologie: Vergelijken van anatomische kenmerken en bouwplannen.
- 2. Paleontologie: Fossielarchieven onthullen evolutionaire geschiedenis.
- 3. Moleculaire Biologie en Genetica: DNA-sequencing, proteïne sequenties, moleculaire klokken.
- 4. Ontwikkelingsbiologie: Vergelijkende embryologie toont gemeenschappelijke ontwikkelingspatronen.
- 5. Gedrags- en Ecologische Kenmerken: Gedeelde gedragingen en habitat aanpassingen.
- 6. Biogeografische Data: Geografische verspreidingspatronen.
- 7. Cytogenetica: Chromosomenaantallen en -structuren.
- 8. Hybridisatie en Reproductieve Compatibiliteit: Vermogen om levensvatbare nakomelingen te produceren.
- 9. Paleogenomica: Oud DNA-analyse van uitgeven soorten.
Het combineren van meerdere bewijstypes verhoogt de nauwkeurigheid, met methoden zoals maximum parsimonie, maximum likelihood en Bayesiaanse inferentie.
Met betrekking tot boerderijdieren