Zeepaardjes zijn kwetsbaar voor veel mariene roofdieren omdat ze zwakke zwemmers zijn en beschermende stekels missen. Hun belangrijkste roofdieren zijn:
- Vissen zoals tonijn, zwaardvis en makreel.
- Vogels, inclusief aalscholvers, pelikansen en meeuwen.
- Zeezoogdieren zoals zeehonden en dolfijnen.
- Schelpdieren inclusief garnalen en krabben.
- Inktvissen zoals inktvissen en zeekatten.
- Andere zeepaardjes, met name grotere soorten die op kleinere jagen.
