Niet-levende componenten van Borneo omvatten:
- Gesteenten en mineralen: oude schisten en gneissen, plus steenkool, goud, koper en diamanten.
- Grotten: uitgebreide kalksteensystemen zoals de Mulu-grotten, thuisbasis van de Sarawak-kamer.
- Stranden en zand: kustlijnen langs de Zuid-Chinese Zee, de Soeloezee en de Celebeszee met verschillende zandtypen.
- Grond: diverse gronden variërend van zure veenmoerassgronden tot vruchtbare vulkanische gronden.
- Waterlichamen: zeeën, koraalriffen, mangroven en rivieren zoals de Kapuas en Rajang.
