Koningin-keizerbaars zijn prachtig en populair, maar ook kwetsbaar voor roofdieren.
- Grotere vissen:
- Zeebaars: Grote, krachtige vissen die prooien op koningin-keizerbaars, vooral jongdieren.
- Muraalepalen: Hinterlaagd roofdieren die gemakkelijk koningin-keizerbaars consumeren.
- Haaien: Sommige rifhaaien hebben koningin-keizerbaars in hun dieet.
- Andere ongewervelden:
- Inktvis: Intelligente hoofdpoten die bekend zijn om koningin-keizerbaars te jagen en te consumeren.
- Mens: Populair in de aquariumhandel, dus overvissing beïnvloedt populaties.
Koningin-keizerbaars zijn relatief weerloos, vooral jongdieren, en vertrouwen op camouflage, wendbaarheid en soms agressie om niet gegeten te worden.