De geelstaartwolapen is bedreigd door:
- Habitatverlies en -fragmentatie: Ontbossing van regenwoud voor houtkap, landbouw, veeteelt en mijnbouw.
- Jacht en stroperij: Voor vlees, bont, huisdieren en gewasbescherming.
- Klimaatverandering: Snelle veranderingen in leefgebied die van invloed zijn op voedsel en schuilplaatsen.