De Sahara-woestijn was ooit een levendige, groene savanne vol met diverse planten- en diersoorten. Vanwege drastische klimaatveranderingen en menselijke activiteiten zijn veel soorten die ooit de regio bewoonden, nu uitgestorven of kritiek bedreigd:
- Nijlpaard (subsoort): Een ondersoort van de gewone nijlpaard die de Niloever en zijrivieren bewoonde.
- Afrikaanse olifant: Streefde door de savannegebieden van de Sahara, inclusief Noord-Afrika.
- Sabeloryx: Een antilope die in de natuur uitgestorven is door overjacht.
- Barbareleeuw: Een leeuwondersoort die de Barbarykusst van Noord-Afrika bewoonde, in de 20e eeuw uitgeploid.
- Noord-Afrikaanse struisvogel: Een ondersoort nu beschouwd als uitgestorven door overjacht en leefgebiedverlies.
- Addax: Een antilope uit de Sahara, nu kritiek bedreigd.
- Sahara-jachtluipaard: Een ondersoort uitgeplooid door leefgebiedverlies, jacht en concurrentie.
- Numidische kraanvogel: Een grote vogelsoort die ooit in Noord-Afrika voorkwam, nu in de natuur uitgestorven.
- Oeros: Een massieve wilde rundersoort die in de 17e eeuw uitgestorven is.
- Reusgiraffe: Een prehistorische giraffesoort veel groter dan moderne giraffes.