Huisdieren
Het is moeilijk om één topgebruiker van selectieve fokkerij te noemen, aangezien de praktijk wijdverspreid is over veel sectoren.
Landbouw: Boeren en fokkers gebruiken het om opbrengst, ziekteresistentie en voedingswaarde te verbeteren in gewassen en vee.
Dierhouderij: Hond- en paardenfokkers gebruiken selectieve fokkerij om specifieke temperamenten en fysieke kenmerken te ontwikkelen.
Onderzoek: Wetenschappers gebruiken het om genetische kenmerken te bestuderen en diermodellen voor ziekten te ontwikkelen.
Hobbyisten: Individuen kunnen het gebruiken om specifieke kenmerken te creëren in huisdieren of sierplanten.
Ethische debatten over dierenwelzijn en onbedoelde gevolgen nemen toe. Gen-editietechnologieën zoals CRISPR kunnen in sommige toepassingen alternatieven bieden.