Huisdieren
Hoewel over het algemeen positief, kan habitatbehoud uitdagingen met zich meebrengen:
• Economische verplaatsing en werkverlies door beperkt landgebruik.
• Beperkte toegang tot hulpbronnen en conflicten met lokale gemeenschappen.
• Hoge kosten en gebrek aan middelen voor monitoring en handhaving.
• Ecosysteemcomplexiteit en onbedoelde gevolgen.
• Mens-wild conflict en moeilijke prioriteitskeuzes.
Andere factoren zijn klimaatverandering en exotische soorten. Deze nadelen zijn niet onvermijdelijk en kunnen worden geminimaliseerd door planning en samenwerking. De voordelen van biodiversiteitsbehoud wegen meestal op tegen de risico's.