Kentucky is de thuisbasis van ten minste 17 gedocumenteerde vleermuissoorten, waaronder:
- Oostelijke rode vleermuis (Lasiurus borealis) – roodbruin, algemeen in de staat
- Grijze vleermuis (Lasiurus cinereus) – de grootste Kentucky vleermuis, met bleke bruine of grijze vacht
- Zilverharige vleermuis (Lasionycteris noctivagans) – donkere vacht met zilveren punten, gevonden in bosgebieden
- Oostelijke pipistrelle (Perimyotis subflavus) – een van de kleinste vleermuizen in Kentucky
- Grote bruine vleermuis (Eptesicus fuscus) – algemeen in de hele staat
- Kleine bruine vleermuis (Myotis lucifugus) – een van de meest talrijke soorten
- Noordelijke langoorvleermuis (Myotis septentrionalis) – gevonden in bosgebieden, met lange oren
Andere mogelijke soorten zijn Rafinesque's grote oorvleermuis, avondvleermuis, Seminole vleermuis en driekleurige vleermuis.
