Huisdieren
Duitsland is de thuisbasis van verschillende zeldzame dieren, ondanks de dichte menselijke bevolking:
Zoogdieren
* Europese bizon: Wedergeïntroduceerd in gebieden zoals het Nationaal Park Eifel.
* Grijze wolf: Keert terug in Oost-Duitsland, vooral in de Lausitz.
* Ris: Herstellend in de Beierse Alpen en bosrijke gebieden.
* Bever: Koloniseert rivieren zoals de Rijn opnieuw.
* Wildkat: Te vinden in het Beierse Woud en de Zwabische Alb.
Vogels
* Staal-adelaar: Herstellend in de Baltische regio.
* Ooievaar: Te vinden in onverstoorde bossen en wetlands.
* Gouden arend: Zeldzaam, te vinden in de Beierse Alpen en de Harzbergen.
* Zee-adelaar: Te vinden langs kustgebieden.
* Auerhoen: Te vinden in de Beierse Alpen en de Harzbergen.
Reptielen en amfibieën
* Europese poelschildpad: Te vinden in geïsoleerde vijvers en meren.
* Vuursalamander: Algemeen in vochtige bossen.
* Gladde slang: Te vinden in graslanden en weilanden.
Vissen
* Huchen: Een grote Donau-forel.
* Europese paling: Kritiek bedreigd, migreert naar de Sargassozee om te kweien.
Insecten
* Zeldzame staartpage: Beperkt tot specifieke habitats.
* Eikbok: Een beschermde soort.
Overige
* Reuzenzoetwatermossel: Te vinden in rivieren en beken.
Duitsland heeft nationale parken, beschermde gebieden en herintroductieprogramma's om deze soorten te helpen herstellen.